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围绕科技创新工程实施需要，启动实施科技平台提质行动，建设完善设施平台，优化平台基地布局，提升管理水平，构建起装备先进、功能完善、运转高效、开放共享、支撑有力的科技平台体系，为我院建设世界一流学科和一流科研院所提供了强有力的支撑。目前，拥有国家级、部门级、院级各类平台550个。

在全国重点实验室重组中，我院水稻生物育种等8个牵头实验室，畜禽生物育种等7个参与的实验室获得批准，获得历史性突破。我院牵头全国重点实验室增加2个，参与的全国重点实验室增加7个。

国家盐碱地综合利用技术创新中心正式获得批复，成为全国农业领域第5家国家技术创新中心。建有6个国家科技资源共享服务平台，其中科学数据中心1个，生物种质与材料资源库5个。其中，国家作物种质资源库的长期库新库正式落成并投入试运行，库容上限提升至150万份，大大缓解目前资源长期保存的压力，并极大地提升国家作物种质资源战略保存和共享服务能力。建设中的国家家养动物种质资源库建成后总建筑面积1.4万平方米，保存容量可突破2500个品种，超低温保存精液、胚胎、细胞等遗传材料可超过3300万份，届时将位居世界首位。试验基地布局不断优化，全院共有109个试验基地分布在27个省（自治区、直辖市），基本覆盖粮食主产区、典型农业生态区。近年来，分别在新疆昌吉、海南三亚新建综合性基地，在黑龙江宝清、甘肃平凉等布局专业验基地。