黄三文研究员带领基因组所经济作物的全基因组设计育种团队构建口感和代谢物的数据模型，系统揭示了番茄风味的化学和遗传基础，并利用图泛基因组解决了遗传变异检测难题，首次获得番茄的图泛基因组，借此找回了番茄育种中“丢失的遗传力”，为解析生物复杂性状的遗传机制和番茄育种提供了新思路。相关成果2017年在Science封面，2022年在Nature发表。
2017年成果被选为封面故事
番茄风味育种技术路线图
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