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中国农科院蔬菜花卉研究所
[中国科学报]破解白菜家族“成员”庞杂原因
发布时间:2021-06-08
|来源: 中国科学报 2021年6月7日|作者:李晨
近日,中国农科院蔬菜花卉研究所蔬菜分子设计育种创新团队揭示了多倍化和结构变异对白菜种内分化的影响机制。该研究鉴定了与结球白菜驯化相关的重要候选基因,并获得了白菜物种丰富的基因组变异。相关成果在线发表于《基因组生物学》。
论文通讯作者王晓武介绍,白菜是芸薹属重要蔬菜,种内多样性极高。研究基于白菜大规模重测序数据,选择了大白菜、小白菜、菜心、油用白菜和芜菁等16份不同类型的白菜资源材料,进行基因组从头组装。结合已发表的大白菜和油用白菜参考基因组,构建了由18个代表性材料组成的白菜泛基因组,并通过构建整合结构变异的图形基因组,鉴定到与大白菜叶球驯化相关的重要候选基因。
此外,研究发现白菜种内分化过程中,基因偏向性丢失持续进行,并导致白菜亚基因组优势继续扩大。研究结果表明,除“两步演化”导致白菜亚基因组优势形成之外,基因组组成可能是导致亚基因组优势形成的另一个重要因素。
该研究不仅加深了对叶球形成驯化的认识,还有助于挖掘更多与重要农艺性状相关的基因,进一步促进白菜育种研究。
相关论文信息:
https://doi.org/10.1186/s13059-021-02383-2
(单位: 中国农业科学院蔬菜花卉研究所)
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